种植辣椒一般常见的病虫害有软腐病、疫病、炭疽病、青枯病、病毒病。详细介绍及防治方法可以参考下列：
辣椒软腐病：软腐病发生时果实病斑初期呈水渍状，后腐烂脱落，有臭味，腐烂后的果实只剩下一层皮，经日晒变白，此病多发于高温多雨季节。辣椒软腐病防治方法：一、避免连作，包括茄子番茄等茄科作物。二、50PPM农用链霉素或新植霉素全株喷施及灌根。
辣椒疫病：苗期、成株期均可以发生，而在早春育苗期间极易发生。疫病发生时，幼苗茎杆病部呈水渍状，叶片萎焉，然后发生软腐，折到枯死，而成株则表现为茎叶局部发生褐色病斑，引起落叶甚至枯死，果实表现为发生水渍状病斑，而后软腐。
辣椒疫病防治方法：
一、苗期浇水不要太多，田间不要太湿，特别是雨天注意排水。二、定植前全地喷施75%百菌清1000倍液后及时铺地膜密封杀菌。三、定植后可以喷代森锰锌可湿性粉剂600倍液加以保护，15天一次，发病初期可喷洒40%已磷铝可湿性粉剂200倍液或75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或64%杀毒矾M8可湿性粉剂400-500倍液，每亩施药液40公斤，隔7-10天一次，连续2-3次。
辣椒碳疽病：叶片染病，初为褪绿色水浸状斑点，逐渐变为褐色，中间淡灰色，病斑上轮生小黑点。果柄有时受害，生褐色凹陷斑且不规则，干燥时干裂。果实被害，初现水浸状黄褐色圆斑或不规则斑，斑面有隆起的同心轮纹，并生有许多黑色小点，潮湿时病斑表面溢出红色粘稠物。果实上的病斑易干缩呈膜状，有的破裂。
辣椒碳疽病防治方法：
一、选用抗病品种，无病株留种。二、种子处理：用凉水预浸1-2小时，然后用55度温水浸10分钟，再放入冷水中冷却后催芽播种。也可先将种子在冷水中浸10-12小时，再用1%硫酸铜浸种5分钟，或用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液浸1小时，捞出后用草木灰或少量石灰中和酸性，再进行播种。三、加强田间管理。合理密植，配方施肥，棚室适时通风、避免高温高湿，注意排水，及时清除病叶、病果及残体，实行与非同种蔬菜2-3年轮作。四、发病初期可喷洒70%甲基托津可湿性粉剂600-800倍液、或80%代森锰锌可湿性粉剂500倍液、或75%百菌清可湿性粉剂800倍液混合喷洒，或50%碳疽福美可湿性粉剞300-400倍液或1：1：200倍的波尔多液，每隔7-10天喷一次，共防2-3次。
辣椒青枯病：植株发病时，个别枝条可能先出现萎焉，后扩展到整个植株，特别是雨后骤晴天气。辣椒青枯病防治方法：一、使用保护性杀菌剂如络氨铜，二、拔除田间的病株，并在株窝内撒施石灰。
辣椒病毒病：主要有两种类型，花叶坏死型，由烟草花叶病毒引起。病叶出现不规则褪绿、浓绿与淡绿相间的花叶症，有的叶上出现褐色坏死斑，自叶片主脉沿茎部出现黑褐色坏死条斑，造成落叶、落花、落果，以及整株死亡，叶片奇形丛生，由黄瓜花叶病毒侵染引起植株变形，表现为病叶增厚，变小或呈蕨叶状，叶脉褪绿，皱缩，凹凸不平呈线状，茎节间缩短，植株矮化，枝叶呈丛簇状，病果呈现花斑或坏死斑，奇形、易脱落。在栽培中如果采用银黑地膜覆盖栽培并配合药剂杀蚜等，则发病率低，一般粗放栽培则要做好杀灭蚜虫的工作预防。
